Dr. Buckaroo Banzai félig japán, félig amerikai hős, aki egyszemélyben pszichiáter, agysebész, titkosügynök, a keleti küzdősportok mestere, feltaláló és rocksztár. A történetünk kezdetén Buckaroo éppen legújabb találmányát teszteli, az oszcillációs túlszabályzót, amelynek segítségével még egy hegyen is képes áttörni kocsijával.
Egy Földünkön ragadt idegen faj, a vörös Lectroidok évtizedek óta arra vártak, hogy valaki végre felfedezze a túlszabályzót, ez a szerkezet ugyanis elengedhetetlen ahhoz, hogy hazatérhessenek végre szülőbolygójukra.
A szerkezetről tudomást szerez Buckaroo ősi ellensége, a hihetetlenül gonosz Dr. Emilio Lizardo is, aki éveken keresztül maga próbálta kifejleszteni a gépet a vörös Lectroidok számára. Most, hogy megszökött az elmegyógyintézetből, újra minden energiáját az ármánykodásra fordítja: terve, hogy megszerzi a gépet és az idegenekkel összefogva leigázza a világot - de mindenek előtt a népszerű Buckaroo Banzai-t, aki rockegyüttesével éppen turnézik és sikert sikerre halmoz!