Mikor Harry Goodman, a zseniális nyomozó eltűnik, a fia, Tim és Harry egykori Pokémon-társa, Pikachu, a detektív (Ryan Reynolds) egyesült erővel erednek a nyomába. Miközben megpróbálják összerakni a Ryme City-t átszövő rejtély részleteit, a páros egy olyan sokkoló összeesküvésre bukkan, amely az egész Pokémon univerzumot veszélybe sodorhatja.
